藥效不同

本質上阿莫西林和青霉素是霉菌生長青霉素的副產品，它是由一個叫亞歷山大·弗萊明的人偶然發現的。他發現這種霉菌生長的產物可以抵抗并消滅有害細菌。于是成為了青霉素的誕生。

阿莫西林是一種源自青霉素原始來源的抗生素。它主要是一種半合成藥物，有助于緩解疼痛以及殺死所有使您生病的有害細菌。在當今的醫學世界中，阿莫西林是治療強烈細菌感染時首選的抗生素。阿莫西林具有正確的藥用化合物，可抵抗胃酸并更有效地滲透血液。

有趣的是，阿莫西林和青霉素都以相同的方式治療細菌。兩種藥物的有效性之間沒有真正的區別。在治療時間中顯示藥物的變化。醫學研究表明，阿莫西林能夠在更短的時間內殺死感染。因此治療持續時間較短。由于治療迅速，兒童經常接受阿莫西林治療;與青霉素的十天更長的治療相比，六天的治療更可取。

抗菌譜不同

從抗菌譜上面來講，青霉素G即平時我們所說的青霉素，屬于是窄譜青霉素，對溶血鏈球菌、肺炎鏈球菌等革蘭氏陽性的球菌、李斯特菌等革蘭氏陽性的桿菌、淋球菌等革蘭氏陰性球菌以及大多數厭氧菌有效，但是對革蘭氏陰性桿菌則是無效的。

而且阿莫西林是屬于廣譜的青霉素，除了青霉素所能覆蓋的細菌之外，還對自身的大腸埃希菌、奇異變形桿菌、沙門菌屬、志賀菌屬以及流感嗜血桿都有著良好的抗菌活性。青霉素對自身腸球菌僅有的抑制作用，常常需要和其他的抗生素相聯合。而阿莫西林對腸球菌作用比較青霉素強。阿莫西林還對幽門螺桿菌有殺滅作用。

適應證不同

阿莫西林是可以用來治療傷寒、傷寒帶菌者;還可以與克拉霉素、蘭索拉唑三聯用藥以根除胃、十二指腸幽門螺桿菌，降低消化性潰瘍復發率。但是青霉素卻沒有這些適應證。

劑型不同

青霉素G是由于不耐酸，口服之后可以迅速被胃酸所滅活，僅僅吸收給藥量的15%左右。所以，青霉素G僅有注射劑型。

而阿莫西林口服則不被胃酸所破壞，而且吸收迅速比較的完全，可以吸收給藥量的60%--75%左右。所以，阿莫西林不但有注射劑，也有口服劑型。

不良反應不同

青霉素比較常見的不良反應為變態反應，主要的表現為過敏性的休克、溶血性的貧血、血清病樣的反應等。

阿莫西林的口服比較常見的不良反應為胃腸道的反應，比如：腹瀉、惡心、嘔吐等相對比較的常見，其次則為皮疹，傳染性的單核細胞增多癥患者比較容易發生。