先天性遺傳性

1.毛根鞘囊腫：過去114度脂腺囊腫屬常染色體顯性遺傳。

2.多發性脂囊瘤：為常染色體顯性遺傳。

3.皮樣囊腫：為先天性生后即有。

4.支氣管源性與甲狀腺舌骨導管囊腫為先天發育不良異常所致。

5.陰莖中線囊腫為先天發育異常所致。

6.發疹性炭毛囊腫病因不清有的報告認為屬常染色體顯性遺傳。

內分泌因素

內分泌因素也是導致囊腫發生的一個很重要的因素，未產婦或未育婦的發病率增加，而妊娠對卵巢癌似有保護作用;月經初潮偏早(12歲之前)、絕經時間在50歲之后、月經過頻、應用促排卵劑超過3個周期(使用時應與您的醫師討論)、性早熟或男性化等也與卵巢囊腫的發生有關。

體內毒素導致

由于每個人的體質和機體各方面功能有所差異，而導致有的人體內毒素較多從而引起囊腫發生。

飲食因素

囊腫的發生和人們的飲食有著密切的關系，食物的污染，如蔬菜等使用的植物生長激素，如家畜家禽等配方飼養中瘦肉精類的激素成份。研究還發現，歐美國家腫瘤的高發病率可能與食物中膽固醇含量高有關系。

周遭環境導致

如整天身處于一個充滿抽煙的環境中，或處于一個輻射較多的區域從而導致體內發生囊腫的概率加大。

不良生活習慣

如果沒有一個好的生活習慣，心理壓力過大等因素造成體質過度酸化，人體整體的機能下降，引起腎虛，肝腎同源，腎卵巢囊腫病理虛肝亦虛，進而引起下焦代謝循環變慢，造成卵巢疾病和內分泌失調，免疫功能下降，從而發展為卵巢組織異常增生，終致卵巢囊腫，甚至癌變。

其他疾病誘發囊腫

在生活中存在有各種疾病，沒有得到較好醫治或者在醫治后恢復不樂觀從而出現感染引發囊腫的發生。