20%的自閉癥者中，他的家族可找到有智能不足、語言發展遲滯和類似自閉癥的病癥。此外，自閉癥男童中約10%有染色體脆弱癥。
具有免疫功能的淋巴細胞數量減少，活性減低，抵抗感染的功能下降。自閉癥患著的身體免疫力普遍低于正常的同齡人，體質較差。
如產傷、宮內窒息、中毒、感染等，先天性風疹病毒感染、巨細胞病毒感染均可能與自閉癥發病有關，這些先天性的損傷會對孩子的未來產生非常大的影響。
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