商標不同

五星茅臺使用的是麥穗圍繞著五星的商標，也是茅臺酒最初的商標;

飛天茅臺為了出口使用了敦煌壁畫中的飛天仙女作為商標。

在1954年5月1日，茅臺酒廠成功注冊了“金輪牌”商標，也就是那個麥穗圍繞著五星的商標，這個商標就是五星茅臺的前身。

當時新中國剛剛成立，國際地位不高，也被一些國外的反華勢力不認同。出口的金輪牌茅臺酒也被反華勢力用來大作文章，他們認為“五星”、“齒輪”、“麥穗”等元素帶有政治商標，呼吁群眾抵制茅臺酒，結果導致茅臺酒海外銷量大跌。

茅臺酒酒廠為了解決這一問題，決定改變外銷茅臺酒的商標。而當時外國人最喜歡的中國元素就是敦煌的壁畫，其中壁畫上的飛天圖案是壁畫的標志性元素，在國外有著非常高的接受度。

另外，飛天還有著外交使者的寓意，與茅臺外銷有著非常合適的契合點，所以茅臺酒酒廠決定使用敦煌壁畫中的飛天仙女作為商標。

到了1958年“飛天”商標在香港、新加坡、馬來西亞等地注冊成功，商標所有權歸貴州省糧油食品進出口公司所有，茅臺酒廠有償使用。從此茅臺酒便是“金輪”牌茅臺酒內銷，“飛天”牌茅臺外銷。

包裝不同

飛天茅臺的外觀比五星茅臺要精美，飛天茅臺在1958年就配上紅票帶了，而五星茅臺到了1991年才配上紅飄帶。

在包裝材質這塊飛天茅臺也要更好，當時用于內銷的金輪牌茅臺(五星茅臺前身)，使用的酒瓶為土陶瓶，而飛天茅臺則是白瓷瓶。

收藏價值不同

早期飛天茅臺主要用于出口，國內很難買到，所以早期的飛天茅臺現存量很少。物以稀為貴，所以同等年份、同等品相的飛天、五星，飛天價格會更高。現在飛天的產量早已經超過五星了，在稀缺性這塊自然不占優勢。