受精卵質量不好

受精卵本身質量不好，自然就會被淘汰，這是生化妊娠最常見的原因。受精卵質量好壞一般直接取決于卵子和精子，而這兩者的好壞跟備孕夫妻平時日常生活習慣有很大的關系，例如：吸煙、酗酒、熬夜、過勞等都會影響其質量。另外，遺傳因素導致受精卵染色體異常也是原因之一。

卵巢黃體不好

孕婦卵巢黃體功能不全，會導致黃體酮分泌不足，子宮內膜異常，影響受精卵在子宮內的著床，從而出現生化妊娠。這種情況可通過黃體中期抽血查黃體功能得知。

子宮因素

女性子宮有問題，比如子宮發育不良、子宮粘膜下肌瘤、子宮內膜息肉、宮腔粘連、子宮內膜結核等都可能影響受精卵著床，出現生化妊娠。

免疫因素

免疫因素導致生化妊娠分兩種情況，具體如下：

同種免疫：精子、精漿或受精卵是抗原物質，與陰道及子宮內膜接觸后，通過免疫反應產生抗體物質，使精子與卵子不能結合或受精卵不能著床。

自身免疫：帶有父方異體抗原成分的胚胎對母體來說是一個異物，母體能產生一種保護性抗體，防止胎兒被母體作為異物排斥。如果母體缺乏保護性抗體，胚胎就會遭到排斥，產生生化或流產。建議驗血檢查免疫抗體、封閉抗體，必要時可行免疫治療。