成分不同

金匱腎氣丸成分是地黃、山藥、山茱萸(酒炙)、茯苓、牡丹皮、澤瀉、桂枝、附子(炙)、牛膝(去頭)、車前子(鹽炙)。溫補腎陽，行氣化水。用于腎虛水腫，腰膝酸軟，小便不利，畏寒肢冷。

右歸丸是由金匱腎氣丸減去“三瀉”(澤瀉、 茯苓、丹皮)，加鹿角膠、菟絲子、杜仲、枸杞子、當歸而成，增加了溫補的作用，使藥效更能專于溫補，是一首十分著名的溫補方劑。

功效不同

金匱腎氣丸平補腎氣，以調整水液代謝為主

張仲景運用金匱腎氣丸，主要治療水液代謝失常的病證，目的在于恢復"腎主水"的生理功能。腎主水液，是指腎具有蒸化和調節津液輸布和排泄，以維持體內水液正常代謝的功能。如果腎的陽氣不足，氣化功能受到影響，水液代謝的調節發生障礙，可引起尿少、尿閉而致水腫;也可因腎陽虛而不能固攝水液，出現小便清長、夜間多尿等病理改變。金匱腎氣丸便是為此而設。

右歸丸溫補腎陽，以恢復藏精功能

右歸丸最早載于張景岳先生的《景岳全書》，方中附子、肉桂、鹿角膠培補腎中之元陽，溫里祛寒，為君藥。熟地黃、山茱萸、枸杞子、山藥滋陰益腎，養肝補脾，填精補髓，取"陰中求陽"之義，為臣藥。佐以菟絲子、杜仲補肝腎，健腰膝;當歸養血和血，與補腎之品相配，以補養精血。

因此金匱腎氣丸用干地黃為君，偏于平補，多用于治療因"腎主水"功能失常而致的水液代謝方面的疾病;而右歸丸改生地為熟地，又用大隊補陽藥，偏于溫補，多用于治療因"腎主藏精"功能失常而致的生殖方面的疾病。