值得注意的是，吃豆腐應該注意科學搭配才能發揮最大的保健功效。甘教授推薦了幾款搭配方法：

豆腐配魚：豆腐所含蛋白質缺乏蛋氨酸和賴氨酸，豆腐和魚一起吃，取長補短，營養價值更高。豆腐含鈣量較多，而魚中富含維生素D，兩者合吃，可使人體對鈣的吸收率提高很多倍。因此特別適合青少年、孕婦及中老年人食用。

豆腐配海帶：豆腐里的皂角苷成分雖然能促進脂肪代謝，阻止動脈硬化發生，但易造成人體碘的缺乏，海帶含碘豐富，將豆腐與海帶一起烹調，十分合理。

豆腐配蘿卜：豆腐屬植物蛋白，多食會引起消化不良，白蘿卜有促進消化的作用，若與豆腐拌食，有利于豆腐的吸收。豆腐含有豐富的鈣，白蘿卜不含草酸，不會阻礙鈣的吸收。

此外，營養高的豆腐雖含有豐富的蛋白質，但缺少一種人體必需的蛋氨酸。如果單獨燒菜，蛋白質的利用率則很低。如果將豆腐和肉類、蛋類食物搭配在一起，可提高豆腐中蛋白質的營養利用率。

豆腐縱有百般好，食用也是有些禁忌的。豆腐含有皂角苷，雖能預防動脈粥樣硬化，但也能促進體內碘的排泄。長期大量吃豆腐容易引起碘的缺乏。另外，豆腐食用過多容易引起消化不良，每餐食用應以100克左右為宜。